บ้านดอนปรูเดิมเป็นที่ราบเนินสูง ตั้งอยู่ทางทิศเหนือของอำเภอศรีประจันต์ ในสมัยก่อนมีต้นไม้ยืนต้นขนาดกลางชนิดหนึ่งขึ้นอยู่หนาแน่นบนที่ราบนี้ จนมีผู้เรียกกลุ่มบ้านนี้ว่าบ้านดอนปรู ต่อมาปี พ.ศ.2512 ทางราชการได้จัดตั้งสถานีอนามัยตำบลดอนปรูขึ้นเพื่อให้บริการประชาชนในเขตของตำบลดอนปรู และพื้นที่ใกล้เคียงของตำบลปลายนาพ.ศ.2538 สร้างอาคารหลังใหญ่ แบบมาตรฐานสถานีอนามัยขนาดกลางเพิ่ม 1 หลัง25 มีนาคม 2545 เริ่มเปิดดำเนินการศูนย์สุขภาพชุมชนนำร่องที่ตำบลดอนปรู ที่อาคารหลังเล็กของสถานีอนามัย มีแพทย์และพยาบาลจากโรงพยาบาลศรีประจันต์ ออกให้บริการทุกวัน จันทร์ และพุธ ในเวลา 8.30-12.00 นกันยายน 2547 – กันยายน 2549 พัฒนาตัวเองเป็นศูนย์สุขภาพชุมชน เพื่อเข้าสู่มาตรฐานPCU ของสำนักงานสาธารณสุขจังหวัดสุพรรณบุรี กระทรวงสาธารณสุข
